De gemeente "Nieuwendammerkerk" maakt deel uit van de protestantse wijkgemeente Amsterdam-Noord die weer onderdeel is van de Protestantse Kerk Amsterdam en de Protestantse Kerk Nederland.
Er zijn twee predikanten en aardig wat vrijwilligers. Voor meer info zie contact.

De gemeente heeft een lange geschiedenis:
De gemeente van de Nieuwendammerkerk was tot 1627 éen met Zunderdorp, waarbij Zunderdorp de moederkerk was.
Van 1627 tot 1658 was de Nieuwendammerkerk samen met de Buiksloterkerk. Van 1658 – 1961 was de gemeente zelfstandig.
Tussen 1928 en 1961 is er in gebouw Moria een confessionele evangelisatie actief geweest. Gerrit Koning heeft de geschiedenis van deze evangelisatievereniging en de toenadering ervan tot de Nieuwendammerkerk uitvoerig beschreven.
Vanaf 1961 is de Nieuwendammerkerk een wijkgemeente van Amsterdam. Van 1968 – 1992 samen met de op 27 december 1992 gesloten Schellingwouderkerk. De gemeente bleef zich ook na de sluiting van de Schellingwouderkerk noemen “(Hervormde) gemeente Nieuwendam-Schellingwoude”. Aan het begin van de 21e eeuw werd de wijkgemeente rondom de Nieuwendammerkerk een kern van de wijkgemeente Amsterdam-Noord van de Protestantse Kerk Amsterdam.
Pinksteren 2007 vormden de kernen Weerenkapel, Noachkerk en Nieuwendam-Schellingwoude zich samen tot de gemeente Nieuwendammerkerk.

Als gemeente vinden we het belangrijk om aandacht te hebben voor elkaar, het geloof samen te vieren en daarover het gesprek aan te gaan. Veel vrijwilligers zijn actief in het kerk- en buurtwerk en in verzorgings- en ziekenhuizen. Ook zingen we graag en veel.

De Nieuwendammerkerk is een zogenaamde waterstaatskerk. Deze staat er vanaf 1849. Eeuwen voor de Nieuwendammerkerk stond er al een kerk. Voor 1849 had de hervormde gemeente te Nieuwendam een kleinere kerk die er sinds 1644 had gestaan maar die door bouwvalligheid moest worden afgebroken. De klok in de huidige toren is uit 1644 en heeft als randschrift: LAUS DEO IN AETERNEUM – Hearicuus Vestrinck me fecit in Campen in 1644 (Lof zij God in eeuwigheid, Hearicuus Vestrinck heeft mij gemaakt in Campen in 1644).

De eerste steen werd gelegd door de zoon van predikant dr. D.G. van der Horst waaraan de initialen op deze steen nog herinneren. De kerk is gebouwd in een sobere eclectische stijl. Het is een rechtgesloten eenvoudige zaalkerk, opgetrokken uit een combinatie van gele IJsselsteen en rode baksteen op een hardstenen plint. Het met rode pannen gedekt zadeldak rust niet alleen op de zijmuren maar wordt inwendig mede opgevangen door in de zijmuren verwerkte schoren. De vierkante toren is frontaal geplaatst met smallere bovenbouw en achtzijdige met leien gedekte naaldspits met sierlijk gesmede bekroning; in het midden is de ingang met hoge, smalle en dubbele paneeldeuren. De brede drie bouwlagen tellende onderbouw van de toren is voorzien van hoeklisenen (= verticale, iets uit de muur springende stroken) ter weerszijden van een rondboogvormig spaarveld en rondboogvormige vensters met ijzeren onderverdeling; bij de begane grond uitgevoerd als bovenlichten en bij de eerste verdieping gekoppeld in een rondboogvormig spaarveld. De tweede verdieping bevat getoogde galmgaten met schuin geplaatste galmborden en voorts staafankers bij de hoeken. Beide torenvolumes zijn aan alle vier zijden afgesloten door een licht hellende, puntvormige en geprofileerde daklijst. In de smallere bovenbouw een rondboog met vier wijzerplaten. Voorts gemetselde kordonlijsten en hardstenen onderdorpels. De kerk is drie traveeën diep en de langszijden zijn voorzien van rondboogvormige vensters en kordonlijsten. Alle vensters zijn voorzien van ijzeren onderverdeling.

Er is een tweede ingang tot de kerk in de rechterzijgevel (zuid).
De zaalkerk heeft inwendig een bijzonder houten kap verwant aan het Engelse 'Hammerbeam'-type, waarbij de spanten voorzien zijn van steekbalken. De tot éen vorm versneden grafzerken zijn nog afkomstig uit de oude kerk. Achter in de kerk is een twee-klaviers mechanisch orgel, oorspronkelijk met aangehangen pedaal, in 1849 gemaakt door J. Hoffmeijer. Gerestaureerd in 1980 door de firma Kaat en Tijhuis uit Kampen. In 2009 wordt deze opnieuw gerestaureerd.
De eikenhouten 17de-eeuwse preekstoel is versierd met Ionische colonetten. De figuren in het gesneden fries symboliseren de kardinale deugden Geloof, Hoop en Liefde en Waarheid en Gerechtigheid. In de cartouches van de panelen geschilderde bloemen en een zwaan met de letters SD, waarschijnlijk verwijzend naar Sunderdorp (nu: Zunderdorp), de gemeente waarvan Nieuwendam eens deel uitmaakte.
In de kerk is een peilsteen waarop is aangegeven hoe hoog de maximale stand van het water was bij de overstroming van het dorp/de streek? in 1916. Links van de kerk is een gemetselde toegang naar het kerkhof met voornamelijk hedentijdse graven.
Rechts van de kerk is een verzorgde tuin en kosterij.
Kerk en kosterij zijn in 2008 en 2009 volledig gerestaureerd volgens de normen van Monumentenzorg.

De kerk is beschikbaar voor activiteiten van de kerkelijke gemeente. Op andere momenten te huur. Zie hiervoor contact